По-видимому, сейчас уже можно ответить на вопрос igmh1983, с которого началось обсуждение.
Материал - известняк. Хим. состав известен, структура известна - с таблицами и фотографиями. Большое спасибо тем, кто провел эту работу и поделился с нами результатами.
По ходу обсуждения обнаружилась новая и интересная информация. Рядом с постройками Саксайуамана есть выходы породы того же состава и микроструктуры. Стены строили не из "ракушечника", а из мелкокристаллического известняка, что естественно. Если рядом есть выходы этой породы, то и тащить далеко на приходилось, что тоже естественно.
В некоторых блоках известняк того же состава, но другой структуры, возможно, взятый из карьера, где и сейчас добывается камень для строительства. Логично предположить, что эти блоки использовались для ремонта в более позднее время.
Вопрос о происхождении мелкокристаллического известняка предлагаю оставить для профессиональной дискуссии между специалистами.
Кроме того, ув. Mauser опубликовал на дружественном ресурсе
http://forum.lah.ru/forum/4-5049 интересные данные о геологическом строении местности, где построен Саксайуаман. Он же сообщил о платформах, на которых стоят камни стен Саксайуамана. Одна из этих платформ треснула, и целостность конструкции стала нарушаться. Кислотные дожди разрушают материал стен, а подземные воды размывают основание стен.
В целом, никакой мистики. Обсуждение "бетонной" версии желающие могут продолжить на указанном выше дружественном ресурсе.